Yayasan Nurul Ulum Pungkuran berawal dari semangat para tokoh masyarakat dan ulama di lingkungan Kauman, Semarang Tengah, yang memiliki cita-cita untuk mendirikan lembaga pendidikan Islam formal bagi anak-anak di sekitar wilayah tersebut. Jauh sebelum resmi berbadan hukum, kegiatan pendidikan sudah berjalan dalam bentuk madrasah dan pengajian yang terpusat di masjid lingkungan sejak sebelum masa kemerdekaan. Secara resmi, Yayasan Nurul Ulum didirikan pada 1 Januari 2012 melalui Surat Keputusan No. 420/4220/2012, dan mulai mengelola lembaga pendidikan secara lebih terstruktur, profesional, dan legal. Unit pendidikan pertamanya adalah SD Islam NU Pungkuran, yang kemudian memperoleh izin operasional dari Dinas Pendidikan pada 23 November 2021. Seiring berjalannya waktu, yayasan terus tumbuh dan memperluas jangkauan pendidikan dengan menjalin kerja sama dalam pengelolaan jenjang pendidikan menengah, yakni melalui SMP Hasanuddin 3.